Sejak tahun 1980, para pemikir Muhammadiyah di Jawa Tengah sesungguhnya berkeinginan mendirikan sebuah Universitas Muhammadiyah di Semarang. Keinginan tersebut merupakan hal yang wajar karena Semarang merupakan Ibu Kota Propinsi. Jika dibandingkan dengan Solo ada Universitas Muhammadiyah Surakarta (UMS), Magelang ada Universitas Muhammadiyah Magelang (UMM), Purwokerto ada Universitas Muhammadiyah Purwokerto (UMP) dan Purworejo ada Universitas Muhammadiyah Purworejo (UMP), tetapi sumber daya yang ada pada waktu itu hanya mampu melahirkan Akademi Keperawatan Muhammadiyah Semarang. Berawal dari Perguruan Tinggi ini kemudian lahir Akademi Gizi, Akademi Analis Kesehatan dan Akademi Ilmu Statistik Muhammadiyah Semarang.
Pada tahun 1998, keinginan yang kuat untuk mendirikan universitas tidaklah berhenti, Pimpinan Wilayah Muhammadiyah Jawa Tengah bersama dengan Pimpinan akademi-akademi yang ada kemudian merintis pendirian universitas tersebut dan Alhamdulillah setahun kemudian lahirlah Universitas Muhammadiyah Semarang (UNIMUS).
Pada tahun 2001, didasarkan atas keinginan yang kuat agar Universitas Muhammadiyah Semarang segera tumbuh gemuk dan sehat, maka melalui Rapat Pimpinan Wilayah Muhammadiyah Jawa Tengah di Karang Anyar memutuskan bahwa Akademi Keperawatan (AKPER), Akademi Gizi (AKZI), Akademi Analis Kesehatan (AAK), dan Akademi Ilmu Statistik (AIS) Muhammadiyah Semarang harus bergabung dengan Universitas Muhammadiyah Semarang. Merealisasi keputusan ini ternyata tidaklah mudah. Disamping AKPER, AKZI, AAK dan AIS telah mempunyai manajemen yang terpisah satu sama lain, status kelembagaan AKPER, AKZI dan AAK dibawah pembinaan Departemen Kesehatan.
Akhirnya, pada tahun 2003, AKPER, AKZI dan AAK telah menyatu dengan Universitas Muhammadiyah Semarang dibawah Fakultas Ilmu Keperawatan dan Kesehatan disingkat FIKKES.
Sesuai dengan perkembangan Universitas maka Saat ini Fakultas Ilmu Keperawatan dan Kesehatan terdiri atas program studi sbb :
- D3 Keperawatan (AKPER),
- D3 Gizi (AKZI),
- D3 Analis Kesehatan (AAK),
- S1 Ilmu Keperawatan,
- S1 Teknologi Pangan,
- D3 Kebidanan.
- D4 Analis Kesehatan
- S1 Ilmu Gizi.